水箱由于太阳能热水器的水源是经过储水箱的储存，经热能转换后成为热水又供给用户，所以热水器的内外质量是影响使用卫生的关健。太阳能热水器水箱有采用铝、铝合金、不锈钢、石英玻璃等材料制成，不锈钢优于其他铝材、角铁、彩钢等材料，储水质量和保温性能较好，不易出现水垢、锈迹。而据专家介绍，太阳能热水属于二次储水，即将自来水储蓄一段时间后才使用。通常，从城市自来水送出的自来水，都是经过严格净化处理和消毒的，水质符合我国《生活饮用水标准》，但是，自来水从水厂输出后，流入输水管网再到各个用户的过程中，就有可能再次受到污染。例如输水管、水箱的内壁都是与生活用水接触最密切的部位，其内壁涂料的质量会直接影响到水质，如果太阳能储水箱的密封不严，铝制或铁制的水箱内易生锈、生藻，使其含有水溶性的有毒成分，甚至具有致癌性的成分溶入水中，就造成了对水质的污染。
输水管由于输水管的材质直接影响饮用水质量，为保护人体健康，国家要求卫生标准必须符合《生活饮用水输配水设备及防护材料安全性评价规定》，所以传统的铸铁输水管易生锈，已被淘汰，取而代之的是塑料管材，目前硬质聚氯乙烯（PVC-U）主要用于城市供水、排水和建筑给、排水等的输送管道。众所周知，太阳能热水器使用的塑料输水管道输送的是热水，因此输水管必须要具备耐高温、耐严寒、耐老化、无毒无味的高标准。然而许多不法生产企业甚至用工业、生活的废脚料生产输水管。这样一来，不合格的塑料输水管经太阳能热水器的热水“浸蚀”，管道中的有机物经加温后会释放并溶解于水中，如残留的二氯乙烷可通过皮肤和食道进入人体内，短期接触刺激眼睛皮肤和呼吸道，可能对中枢神经系统及肺部造成危害，长期或反复接触可能会引起皮炎，可能对肝、肾和黏膜发生作用；其残留的氯乙烯短期接触会刺激眼睛，长期或反复接触可能对肝、血管和结缔组织发生作用，引发慢性疾病。
输水管由于输水管的材质直接影响饮用水质量，为保护人体健康，国家要求卫生标准必须符合《生活饮用水输配水设备及防护材料安全性评价规定》，所以传统的铸铁输水管易生锈，已被淘汰，取而代之的是塑料管材，目前硬质聚氯乙烯（PVC-U）主要用于城市供水、排水和建筑给、排水等的输送管道。众所周知，太阳能热水器使用的塑料输水管道输送的是热水，因此输水管必须要具备耐高温、耐严寒、耐老化、无毒无味的高标准。然而许多不法生产企业甚至用工业、生活的废脚料生产输水管。这样一来，不合格的塑料输水管经太阳能热水器的热水“浸蚀”，管道中的有机物经加温后会释放并溶解于水中，如残留的二氯乙烷可通过皮肤和食道进入人体内，短期接触刺激眼睛皮肤和呼吸道，可能对中枢神经系统及肺部造成危害，长期或反复接触可能会引起皮炎，可能对肝、肾和黏膜发生作用；其残留的氯乙烯短期接触会刺激眼睛，长期或反复接触可能对肝、血管和结缔组织发生作用，引发慢性疾病。